がん細胞のMOSAIC空間アトラスも作成される

Owkin、NanoString Technologies、およびがん研究機関は、ピッツバーグ大学、ギュスターヴ・ルシー、ローザンヌ大学病院、エルランゲン・ニュルンベルク大学、ベルリン・シャリテ大学、およびベルリン大学で MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas In Cancer) を立ち上げています。臨床腫瘍学会の年次総会。

MOSAIC は、腫瘍の構造に関する情報を提供する一連の技術である空間オミックスの使用を通じてがん研究に革命を起こす 5,000 万ドルのプロジェクトです。

空間オミクスにより、研究者はほぼ単一細胞の解像度で腫瘍を検査できると同時に、腫瘍と免疫細胞の位置と分子活性を明らかにすることができます。 これは分子相互作用の詳細なマップを提供し、科学者が腫瘍とその環境の間の重要な関係を解読できるようにします。

MOSAIC は、マルチモーダルな患者データや人工知能と組み合わせて空間オミクス データを生成および分析することにより、最も治療の難しいがんのいくつかに対する次の治療波の扉を開くことを目指しています。

オーキン氏は、空間オミクス技術を利用したこの種の初の取り組みであり、MOSAICは腫瘍治療研究に新たな分野を開く可能性を秘めていると述べた。 Owkin は MOSAIC の構築に 5,000 万ドルを投資します。 患者から採取した 7,000 個の腫瘍サンプルを使用するため、既存の空間オミクス データセットよりも 100 倍以上大きくなります。 Owkin と MOSAIC パートナーは、バイオマーカーと新しい治療法を追求するために、免疫腫瘍学疾患のサブタイプについてこのリソースを採掘します。

Owkin の共同創設者兼 CEO である Thomas Clozel 氏は、「空間オミクス、マルチモーダルな患者データ、AI の融合は、腫瘍学研究の次の革命を推進し、患者のための画期的な治療の次の波を解き放つでしょう。MOSAIC は私たちを助けてくれるでしょう」と述べています。 、そして私たちのパートナーは、がんとの闘いにおいて前例のない進歩を遂げています。」

NanoString の社長兼 CEO であるブラッド・グレイは次のように述べています。「このプロジェクトは、がん生物学に対する私たちの理解を変革し、新しい診断法や治療法の開発を促進する可能性を秘めています。これは前例のないコラボレーションであり、NanoString の強力な空間生物学プラットフォーム、最高品質の空間生物学プラットフォームを統合します。トップレベルのがん研究センターから採取された、臨床的に注釈が付けられたがんサンプル、そしてオーキンの卓越した AI テクノロジーと分析。」

ピッツバーグ大学医学部のがん研究担当副学長兼ヒルマン腫瘍学教授、UPMCヒルマンがんセンター所長のロバート・フェリス氏は、「ピッツバーグ大学はMOSAICコンソーシアムに参加できることに興奮している」と述べた。 「UPMC ヒルマンがんセンターの空間オミクス専門知識を環境内のがん細胞の理解に活用しています。私たちは他の大学や業界パートナーと協力して、がんの検出、治療、予防に役立つ実用的な洞察を明らかにすることに熱心に取り組んでいます。」

Nature Methods によって年間最優秀メソッドとして認められた空間分解分子プロファイリング (空間オミクスとも呼ばれます) は、分子発現を定量化し、局在化するための高度な技術グループであり、科学者に単一細胞に近い解像度で腫瘍構造のビューを提供し、次のことを明らかにします。腫瘍細胞と非腫瘍細胞間の相互作用。

分子の発現を測定し、それを腫瘍サンプル内のその位置にマッピングすることにより、空間オミクスにより、研究者は腫瘍の不均一性、細胞間コミュニケーション、および腫瘍と免疫系の相互作用に「ズームイン」することができます。 この革新的なアプローチは、前例のない科学的進歩を促進し、病気のメカニズムに関する私たちの基本的な理解を変えることになります。

NanoString の空間オミクス技術を使用して研究センターからの患者データを分析し、RNA-seq、プロテオミクス、組織学、その他の医療データと組み合わせた後、Owkin はデータ プラットフォームを開発し、ディープ ニューラル ネットワークを含む機械学習を使用して、新しいがん生物学を解明します。そして潜在的な治療法。

MOSAICは当初、非小細胞肺がん、トリプルネガティブ乳がん、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、卵巣がん、神経膠芽腫、中皮腫、膀胱がんなど、満たされていない医療ニーズを持つ複数のがんに焦点を当てます。 初期の研究期間の後、MOSAIC とその標準化されたデータ生成および分析手法は世界の生物医学コミュニティに利用可能になり、腫瘍学研究の進歩をさらに推進します。

MOSAIC の規模は、既存の空間オミックス研究を大幅に上回ります。 これまでの取り組みは、ブレークスルーを推進するには 2 桁も小さすぎます。 現在、これらのデータモダリティを含むほとんどの研究は、サンプルサイズ（通常は 50 未満）によって制約されています。これに対し、MOSAIC は 7,000 人の患者からのデータを分析するため、科学者は現在可能であるよりも 100 倍大きいデータコホートで研究を行うことができます。